SOD1

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SOD1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1AZV, 1BA9, 1DSW, 1FUN, 1HL4, 1HL5, 1KMG, 1L3N, 1MFM, 1N18, 1N19, 1OEZ, 1OZT, 1OZU, 1P1V, 1PTZ, 1PU0, 1RK7, 1SOS, 1SPD, 1UXL, 1UXM, 2AF2, 2C9S, 2C9U, 2C9V, 2GBT, 2GBU, 2GBV, 2LU5, 2MP3, 2NNX, 2R27, 2V0A, 2VR6, 2VR7, 2VR8, 2WKO, 2WYT, 2WYZ, 2WZ0, 2WZ5, 2WZ6, 2XJK, 2XJL, 2ZKW, 2ZKX, 2ZKY, 3CQP, 3CQQ, 3ECU, 3ECV, 3ECW, 3GQF, 3GTV, 3GZO, 3GZP, 3GZQ, 3H2P, 3H2Q, 3HFF, 3K91, 3KH3, 3KH4, 3LTV, 3QQD, 3RE0, 3T5W, 4A7G, 4A7Q, 4A7S, 4A7T, 4A7U, 4A7V, 4B3E, 4BCY, 4BCZ, 4BD4, 4FF9, 4MCM, 4MCN, 4NIN, 4NIP, 4OH2, 4XCR

Identifiants
AliasesSOD1
IDs externesOMIM: 147450 MGI: 98351 HomoloGene: 392 GeneCards: SOD1
Position du gène (Homme)
Chromosome 21 humain
Chr.Chromosome 21 humain[1]
Chromosome 21 humain
Localisation génomique pour SOD1
Localisation génomique pour SOD1
Locus21q22.11Début31,659,666 bp[1]
Fin31,668,931 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 16 (souris)
Chr.Chromosome 16 (souris)[2]
Chromosome 16 (souris)
Localisation génomique pour SOD1
Localisation génomique pour SOD1
Locus16 C3.3|16 51.56 cMDébut90,017,642 bp[2]
Fin90,023,217 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • pont

  • Pars compacta

  • ganglion sensitif d’un nerf spinal

  • lateral nuclear group of thalamus

  • noyau vestibulaire supérieur

  • pars reticulata

  • right lobe of liver

  • Brodmann area 10

  • right adrenal cortex

  • hypothalamus
Fortement exprimé dans
  • otolith organ

  • utricle

  • Cellule de Paneth

  • cumulus cell

  • fosse

  • primary oocyte

  • vestibular sensory epithelium

  • Epithelium of choroid plexus

  • facial motor nucleus

  • condyle
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ion métal
  • liaison enzymatique
  • activité d'oxydoréductase
  • superoxide dismutase activity
  • protein homodimerization activity
  • zinc ion binding
  • liaison protéique
  • copper ion binding
  • protein phosphatase 2B binding
  • chaperone binding
  • antioxidant activity
  • identical protein binding
  • superoxide dismutase copper chaperone activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • cytosol
  • mitochondrial intermembrane space
  • région extracellulaire
  • mitochondrie
  • neuron projection
  • dendrite cytoplasm
  • dense core granule
  • noyau
  • gaine de myéline
  • peroxysome
  • lysosome
  • exosome
  • matrice extracellulaire
  • membrane plasmique
  • secretory granule
  • nucléoplasme
  • neuronal cell body
  • Matrice mitochondriale
  • vésicule cytoplasmique
  • axon cytoplasm
  • milieu extracellulaire
  • complexe macromoléculaire
Processus biologique
  • negative regulation of neuron apoptotic process
  • muscle cell cellular homeostasis
  • response to copper ion
  • Placentation
  • response to amphetamine
  • positive regulation of catalytic activity
  • response to heat
  • response to organic substance
  • anterograde axonal transport
  • spermatogenèse
  • response to ethanol
  • neurofilament cytoskeleton organization
  • heart contraction
  • implantation de l'embryon
  • locomotory behavior
  • thymus development
  • removal of superoxide radicals
  • regulation of GTPase activity
  • transmission of nerve impulse
  • response to antibiotic
  • myeloid cell homeostasis
  • response to oxidative stress
  • reactive oxygen species metabolic process
  • regulation of T cell differentiation in thymus
  • retina homeostasis
  • response to nutrient levels
  • hydrogen peroxide biosynthetic process
  • regulation of protein kinase activity
  • negative regulation of cholesterol biosynthetic process
  • cellular response to potassium ion
  • retrograde axonal transport
  • glutathione metabolic process
  • response to antipsychotic drug
  • negative regulation of apoptotic process
  • cellular response to cadmium ion
  • response to carbon monoxide
  • regulation of blood pressure
  • response to axon injury
  • relaxation of vascular associated smooth muscle
  • ovarian follicle development
  • cellular response to ATP
  • response to hydrogen peroxide
  • superoxide metabolic process
  • peripheral nervous system myelin maintenance
  • response to superoxide
  • positive regulation of cytokine production
  • regulation of multicellular organism growth
  • vieillissement
  • platelet degranulation
  • ouïe
  • superoxide anion generation
  • auditory receptor cell stereocilium organization
  • regulation of mitochondrial membrane potential
  • positive regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
  • positive regulation of apoptotic process
  • positive regulation of superoxide anion generation
  • regulation of organ growth
  • cellular iron ion homeostasis
  • response to reactive oxygen species
  • cellular response to oxidative stress
  • interleukin-12-mediated signaling pathway
  • negative regulation of inflammatory response
  • positive regulation of phagocytosis
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

6647

20655

Ensembl

ENSG00000142168

ENSMUSG00000022982

UniProt

P00441

P08228

RefSeq (mRNA)

NM_000454

NM_011434

RefSeq (protéine)

NP_000445

NP_035564

Localisation (UCSC)Chr 21: 31.66 – 31.67 MbChr 16: 90.02 – 90.02 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
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La superoxide dismutase [Cu-Zn] aussi connue comme SOD1 est une enzyme codée par le gène SOD1 situé sur le chromosome 21 humain. Elle appartient a la superfamille des superoxyde dismutases, et est impliquée dans les mécanismes de l'apoptose ainsi que dans la sclérose latérale amyotrophique.

Structure

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Fonctions physiologiques

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Physiopathologie

Sclérose latérale amytrophique

Les souris dépourvues de SOD1 (CuZn-SOD cytosolique) développent une grande quantité de pathologies parmi lesquelles le cancer du foie, une accélération de la perte de masse musculaire avec l'âge, une incidence précoce de la cataracte et une espérance de vie réduite.

Dans la Sclérose latérale amyotrophique (SLA) familiale, les patients présentent dans 20 % des cas des mutations des gènes codants SOD1. Actuellement plus d'une centaine mutations sont connues. Pour permettre d'étudier la maladie, des modèles souris ont été développés avec des surexpressions de la protéine SOD1 humaine muté (Gurney et al, 1994) , et donnent un gain de fonction toxique à la protéine. Ces souris développent des symptômes assimilés à la SLA.

Syndrome de Down

Le syndrome de Down est causée par la triplication du chromosome 21. Le stress oxydant lié à cette maladie est lié à la multiplication et donc à l'expression exacerbée du gène SOD1 situé sur le chromosome 21. Cette expression anormale conduit en particulier à une surproduction de peroxyde d'hydrogène, endommageant ainsi les cellules.

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  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000142168 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022982 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine