Aptamer

Struktura RNK aptamera specifičnog za biotin. Površina i osnova aptamera su prikazani žuto. Biotin (sfere) se dobro uklapa u šupljinu RNK površine

Aptameri (od lat. aptus - stati, i grč. meros - region) su oligonukleinske kiseline ili peptidni molekuli koji se vezuju za specifični ciljni molekul. Prirodni aptameri postoje kao riboprekidači. U laboratoriji se aptameri opično formiraju selekcijom iz velikog mnoštva randomnih sekvenci. Aptameri nalaze primenu u baznim istraživanjima, a koriste se i za kliničke svrhe kao makromolekulski lekovi. Aptameri se mogu kombinovati sa ribozimima radi samostalnog presecanja u prisustvu ciljnog molekula.

Aptameri se mogu klasifikovati kao:

  • DNK ili RNK ili KNK aptameri. Oni se obično sastoje od kratkih lanaca oligonukleotida.
  • Peptidni aptameri. Oni se sastoje od kratkih promenljivih peptidnih domena, vezanih na oba kraja za proteinsku osnovu.

Literatura

  • Ellington AD, Szostak JW (Aug 1990). „In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands”. Nature 346 (6287): 818–22. DOI:10.1038/346818a0. PMID 1697402. 
  • Bock LC, Griffin LC, Latham JA, Vermaas EH, Toole JJ (Feb 1992). „Selection of single-stranded DNA molecules that bind and inhibit human thrombin”. Nature 355 (6360): 564–6. DOI:10.1038/355564a0. PMID 1741036. 
  • Hoppe-Seyler F, Butz K (2000). „Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine”. J Mol Med. 78 (8): 426–30. DOI:10.1007/s001090000140. PMID 11097111. 
  • Carothers JM, Oestreich SC, Davis JH, Szostak JW (Apr 2004). „Informational complexity and functional activity of RNA structures”. J Am Chem Soc. 126 (16): 5130–7. DOI:10.1021/ja031504a. PMID 15099096. 
  • Cohen BA, Colas P, Brent R (Nov 1998). „An artificial cell-cycle inhibitor isolated from a combinatorial library”. Proc Natl Acad Sci USA. 95 (24): 14272–7. DOI:10.1073/pnas.95.24.14272. PMC 24363. PMID 9826690. 
  • Binkowski BF, Miller RA, Belshaw PJ (Jul 2005). „Ligand-regulated peptides: a general approach for modulating protein-peptide interactions with small molecules”. Chem Biol. 12 (7): 847–55. DOI:10.1016/j.chembiol.2005.05.021. PMID 16039531. 
  • Sullenger BA, Gilboa E (Jul 2002). „Emerging clinical applications of RNA”. Nature 418 (6894): 252–8. DOI:10.1038/418252a. PMID 12110902. 
  • Ng EW, Shima DT, Calias P, Cunningham ET, Guyer DR, Adamis AP (Feb 2006). „Pegaptanib, a targeted anti-VEGF aptamer for ocular vascular disease”. Nat Rev Drug Discov 5 (2): 123–32. DOI:10.1038/nrd1955. PMID 16518379. 
  • Drabovich AP, Berezovski M, Okhonin V, Krylov SN (May 2006). „Selection of smart aptamers by methods of kinetic capillary electrophoresis”. Anal Chem. 78 (9): 3171–8. DOI:10.1021/ac060144h. PMID 16643010. 
  • Cho EJ, Lee JW, Ellington, AD (2009). „Applications of Aptamers as Sensors”. Annual Review of Analytical Chemistry 2 (1): 241–64. DOI:10.1146/annurev.anchem.1.031207.112851. PMID 20636061. Arhivirano iz originala na datum 2019-09-24. Pristupljeno 2014-06-20. 

Spoljašnje veze