GCA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1F4O, 1F4Q, 1K94, 1K95

Ідентифікатори

Символи

GCA, GCL, grancalcin

Зовнішні ІД

OMIM: 607030 MGI: 1918521 HomoloGene: 22702 GeneCards: GCA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity • protein heterodimerization activity • calcium ion binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • екзосома • мембрана • extracellular region • гіалоплазма • azurophil granule lumen • цитоплазма
Біологічний процес	• membrane fusion • протеоліз • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


25801


227960

Ensembl


ENSG00000115271


ENSMUSG00000026893

UniProt


P28676


Q8VC88

RefSeq (мРНК)

NM_012198 NM_001330265 NM_001330266 NM_001330267 NM_001330268
NM_001330270 NM_001330271


NM_145523

RefSeq (білок)

NP_001317194 NP_001317195 NP_001317196 NP_001317197 NP_001317199
NP_001317200 NP_036330


NP_663498

Локус (UCSC)

Хр. 2: 162.32 – 162.37 Mb

Хр. 2: 62.49 – 62.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GCA (англ. Grancalcin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 24 010^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAYPGYGGGF	GNFSIQVPGM	QMGQPVPETG	PAILLDGYSG	PAYSDTYSSA
GDSVYTYFSA	VAGQDGEVDA	EELQRCLTQS	GINGTYSPFS	LETCRIMIAM
LDRDHTGKMG	FNAFKELWAA	LNAWKENFMT	VDQDGSGTVE	HHELRQAIGL
MGYRLSPQTL	TTIVKRYSKN	GRIFFDDYVA	CCVKLRALTD	FFRKRDHLQQ
GSANFIYDDF	LQGTMAI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Teahan C.G., Totty N.F., Segal A.W. (1992). Isolation and characterization of grancalcin, a novel 28 kDa EF-hand calcium-binding protein from human neutrophils. Biochem. J. 286: 549—554. PMID 1530588 DOI:10.1042/bj2860549
Lollike K., Johnsen A.H., Durussel I., Borregaard N., Cox J.A. (2001). Biochemical characterization of the penta-EF-hand protein grancalcin and identification of L-plastin as a binding partner. J. Biol. Chem. 276: 17762—17769. PMID 11279160 DOI:10.1074/jbc.M100965200
Hansen C., Tarabykina S., la Cour J.M., Lollike K., Berchtold M.W. (2003). The PEF family proteins sorcin and grancalcin interact in vivo and in vitro. FEBS Lett. 545: 151—154. PMID 12804766 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00518-0
Jia J., Han Q., Borregaard N., Lollike K., Cygler M. (2000). Crystal structure of human grancalcin, a member of the penta-EF-hand protein family. J. Mol. Biol. 300: 1271—1281. PMID 10903868 DOI:10.1006/jmbi.2000.3925
Jia J., Borregaard N., Lollike K., Cygler M. (2001). Structure of Ca(2+)-loaded human grancalcin. Acta Crystallogr. D. 57: 1843—1849. PMID 11717497 DOI:10.1107/S0907444901016511

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15990 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, P28676 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.