ITPA

ITPA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2CAR, 2I5D, 2J4E, 4F95

Ідентифікатори
Символи ITPA, C20orf37, HLC14-06-P, dJ794I6.3, My049, ITPase, NTPase, inosine triphosphatase, DEE35
Зовнішні ІД OMIM: 147520 MGI: 96622 HomoloGene: 6289 GeneCards: ITPA
Пов'язані генетичні захворювання
гепатит C, inosine triphosphatase deficiency[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleotide binding
dITP diphosphatase activity
XTP diphosphatase activity
ITP diphosphatase activity
hydrolase activity
зв'язування з іоном металу
nucleotide diphosphatase activity
NADH pyrophosphatase activity
nucleoside-triphosphate diphosphatase activity
identical protein binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма

Біологічний процес

ITP catabolic process
nucleotide metabolic process
GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization
nucleoside triphosphate catabolic process
purine nucleotide catabolic process
deoxyribonucleoside triphosphate catabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3704
16434
Ensembl
ENSG00000125877
ENSMUSG00000074797
UniProt
Q9BY32
Q9D892
RefSeq (мРНК)
NM_001267623
NM_033453
NM_181493
NM_001324236
NM_001324237
NM_001324238
NM_001324240
NM_001351739
NM_025922
NM_001362648
RefSeq (білок)
NP_001254552
NP_001311165
NP_001311166
NP_001311167
NP_001311169
NP_258412
NP_852470
NP_001338668
NP_080198
NP_001349577
Локус (UCSC) Хр. 20: 3.21 – 3.22 Mb Хр. 2: 130.51 – 130.52 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITPA (англ. Inosine triphosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 194 амінокислот, а молекулярна маса — 21 446[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAASLVGKKIVFVTGNAKKLEEVVQILGDKFPCTLVAQKIDLPEYQGEPD
EISIQKCQEAVRQVQGPVLVEDTCLCFNALGGLPGPYIKWFLEKLKPEGL
HQLLAGFEDKSAYALCTFALSTGDPSQPVRLFRGRTSGRIVAPRGCQDFG
WDPCFQPDGYEQTYAEMPKAEKNAVSHRFRALLELQEYFGSLAA

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм нуклеотидів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Burgis N.E., Cunningham R.P. (2007). Substrate specificity of RdgB protein, a deoxyribonucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase. J. Biol. Chem. 282: 3531—3538. PMID 17090528 DOI:10.1074/jbc.M608708200
  • Porta J., Kolar C., Kozmin S.G., Pavlov Y.I., Borgstahl G.E. (2006). Structure of the orthorhombic form of human inosine triphosphate pyrophosphatase. Acta Crystallogr. F. 62: 1076—1081. PMID 17077483 DOI:10.1107/S1744309106041790
  • Cao H., Hegele R.A. (2002). DNA polymorphisms in ITPA including basis of inosine triphosphatase deficiency. J. Hum. Genet. 47: 620—622. PMID 12436200 DOI:10.1007/s100380200095

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ITPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6176 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, Q9BY32 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.