ITPA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CAR, 2I5D, 2J4E, 4F95 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITPA, C20orf37, HLC14-06-P, dJ794I6.3, My049, ITPase, NTPase, inosine triphosphatase, DEE35 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 147520 MGI: 96622 HomoloGene: 6289 GeneCards: ITPA |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
гепатит C, inosine triphosphatase deficiency[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • dITP diphosphatase activity • XTP diphosphatase activity • ITP diphosphatase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • nucleotide diphosphatase activity • NADH pyrophosphatase activity • nucleoside-triphosphate diphosphatase activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • ITP catabolic process • nucleotide metabolic process • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • nucleoside triphosphate catabolic process • purine nucleotide catabolic process • deoxyribonucleoside triphosphate catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001267623 NM_033453 NM_181493 NM_001324236 NM_001324237
| NM_001324238 NM_001324240 NM_001351739 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001254552 NP_001311165 NP_001311166 NP_001311167 NP_001311169
| NP_258412 NP_852470 NP_001338668 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 3.21 – 3.22 Mb | Хр. 2: 130.51 – 130.52 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ITPA (англ. Inosine triphosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 194 амінокислот, а молекулярна маса — 21 446[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAASLVGKKI | | VFVTGNAKKL | | EEVVQILGDK | | FPCTLVAQKI | | DLPEYQGEPD |
EISIQKCQEA | | VRQVQGPVLV | | EDTCLCFNAL | | GGLPGPYIKW | | FLEKLKPEGL |
HQLLAGFEDK | | SAYALCTFAL | | STGDPSQPVR | | LFRGRTSGRI | | VAPRGCQDFG |
WDPCFQPDGY | | EQTYAEMPKA | | EKNAVSHRFR | | ALLELQEYFG | | SLAA |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм нуклеотидів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Burgis N.E., Cunningham R.P. (2007). Substrate specificity of RdgB protein, a deoxyribonucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase. J. Biol. Chem. 282: 3531—3538. PMID 17090528 DOI:10.1074/jbc.M608708200
- Porta J., Kolar C., Kozmin S.G., Pavlov Y.I., Borgstahl G.E. (2006). Structure of the orthorhombic form of human inosine triphosphate pyrophosphatase. Acta Crystallogr. F. 62: 1076—1081. PMID 17077483 DOI:10.1107/S1744309106041790
- Cao H., Hegele R.A. (2002). DNA polymorphisms in ITPA including basis of inosine triphosphatase deficiency. J. Hum. Genet. 47: 620—622. PMID 12436200 DOI:10.1007/s100380200095
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6176 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BY32 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |