PIGT |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PIGT, MCAHS3, NDAP, PNH2, CGI-06, phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class T |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610272 MGI: 1926178 HomoloGene: 6134 GeneCards: PIGT |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 3[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GPI-anchor transamidase activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • GPI-anchor transamidase complex • endoplasmic reticulum membrane • integral component of endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • attachment of GPI anchor to protein • neuron differentiation • GPI anchor biosynthetic process • neuron apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001184728 NM_001184729 NM_001184730 NM_015937 |
| | NM_133779 NM_001362644 NM_001362645 NM_001378795 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001171657 NP_001171658 NP_001171659 NP_057021 |
| | NP_598540 NP_001349573 NP_001349574 NP_001365724 NP_001394210 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 45.42 – 45.46 Mb | Хр. 2: 164.34 – 164.35 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PIGT (англ. Phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class T) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 578 амінокислот, а молекулярна маса — 65 700[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAAMPLALL | | VLLLLGPGGW | | CLAEPPRDSL | | REELVITPLP | | SGDVAATFQF |
RTRWDSELQR | | EGVSHYRLFP | | KALGQLISKY | | SLRELHLSFT | | QGFWRTRYWG |
PPFLQAPSGA | | ELWVWFQDTV | | TDVDKSWKEL | | SNVLSGIFCA | | SLNFIDSTNT |
VTPTASFKPL | | GLANDTDHYF | | LRYAVLPREV | | VCTENLTPWK | | KLLPCSSKAG |
LSVLLKADRL | | FHTSYHSQAV | | HIRPVCRNAR | | CTSISWELRQ | | TLSVVFDAFI |
TGQGKKDWSL | | FRMFSRTLTE | | PCPLASESRV | | YVDITTYNQD | | NETLEVHPPP |
TTTYQDVILG | | TRKTYAIYDL | | LDTAMINNSR | | NLNIQLKWKR | | PPENEAPPVP |
FLHAQRYVSG | | YGLQKGELST | | LLYNTHPYRA | | FPVLLLDTVP | | WYLRLYVHTL |
TITSKGKENK | | PSYIHYQPAQ | | DRLQPHLLEM | | LIQLPANSVT | | KVSIQFERAL |
LKWTEYTPDP | | NHGFYVSPSV | | LSALVPSMVA | | AKPVDWEESP | | LFNSLFPVSD |
GSNYFVRLYT | | EPLLVNLPTP | | DFSMPYNVIC | | LTCTVVAVCY | | GSFYNLLTRT |
FHIEEPRTGG | | LAKRLANLIR | | RARGVPPL |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Ohishi K., Inoue N., Kinoshita T. (2001). PIG-S and PIG-T, essential for GPI anchor attachment to proteins, form a complex with GAA1 and GPI8. EMBO J. 20: 4088—4098. PMID 11483512 DOI:10.1093/emboj/20.15.4088
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- Ohishi K., Nagamune K., Maeda Y., Kinoshita T. (2003). Two subunits of glycosylphosphatidylinositol transamidase, GPI8 and PIG-T, form a functionally important intermolecular disulfide bridge. J. Biol. Chem. 278: 13959—13967. PMID 12582175 DOI:10.1074/jbc.M300586200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PIGT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14938 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q969N2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |