SNAPIN

Ідентифікатори

Символи

SNAPIN, BLOC1S7, BLOS7, SNAPAP, BORCS3, SNAP associated protein

Зовнішні ІД

OMIM: 607007 MGI: 1333745 HomoloGene: 8251 GeneCards: SNAPIN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • Синаптичні бульбашки • BLOC-1 complex • Golgi membrane • синапс • synaptic vesicle membrane • secretory granule • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • axon cytoplasm • лізосома • lysosomal membrane • комплекс Ґольджі • BORC complex
Біологічний процес	• negative regulation of neuron projection development • positive regulation of late endosome to lysosome transport • endosome to lysosome transport • synaptic vesicle exocytosis • synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane • anterograde axonal transport • melanosome organization • GO:0000046 autophagosome maturation • synaptic vesicle transport • terminal button organization • anterograde synaptic vesicle transport • intracellular protein transport • GO:0022415 viral process • neuron projection development • regulation of protein binding • synaptic vesicle maturation • GO:0010554 neurotransmitter secretion • екзоцитоз • chemical synaptic transmission • retrograde axonal transport • late endosome to lysosome transport • protein maturation • lysosomal lumen acidification • lysosome organization • lysosome localization • regulation of synaptic vesicle exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23557


20615

Ensembl


ENSG00000143553


ENSMUSG00000001018

UniProt


O95295


Q9Z266

RefSeq (мРНК)


NM_012437


NM_133854

RefSeq (білок)


NP_036569


NP_598615

Локус (UCSC)

Хр. 1: 153.66 – 153.66 Mb

Хр. 3: 90.4 – 90.4 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAPIN (англ. SNAP associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 136 амінокислот, а молекулярна маса — 14 874^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGAGSAAVS	GAGTPVAGPT	GRDLFAEGLL	EFLRPAVQQL	DSHVHAVRES
QVELREQIDN	LATELCRINE	DQKVALDLDP	YVKKLLNARR	RVVLVNNILQ
NAQERLRRLN	HSVAKETARR	RAMLDSGIYP	PGSPGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, екзоцитоз, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, апараті гольджі, синапсах.

Література

Ilardi J.M., Mochida S., Sheng Z.-H. (1999). Snapin: a SNARE-associated protein implicated in synaptic transmission. Nat. Neurosci. 2: 119—124. PMID 10195194 DOI:10.1038/5673
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hunt R.A., Edris W., Chanda P.K., Nieuwenhuijsen B., Young K.H. (2003). Snapin interacts with the N-terminus of regulator of G protein signaling 7. Biochem. Biophys. Res. Commun. 303: 594—599. PMID 12659861 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00400-5
Starcevic M., Dell'Angelica E.C. (2004). Identification of snapin and three novel proteins (BLOS1, BLOS2, and BLOS3/reduced pigmentation) as subunits of biogenesis of lysosome-related organelles complex-1 (BLOC-1). J. Biol. Chem. 279: 28393—28401. PMID 15102850 DOI:10.1074/jbc.M402513200
Granata A., Watson R., Collinson L.M., Schiavo G., Warner T.T. (2008). The dystonia-associated protein torsinA modulates synaptic vesicle recycling. J. Biol. Chem. 283: 7568—7579. PMID 18167355 DOI:10.1074/jbc.M704097200
Granata A., Koo S.J., Haucke V., Schiavo G., Warner T.T. (2011). CSN complex controls the stability of selected synaptic proteins via a torsinA-dependent process. EMBO J. 30: 181—193. PMID 21102408 DOI:10.1038/emboj.2010.285

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17145 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O95295 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.