钙蛋白酶9

钙蛋白酶9
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
PDBID列表

1ZIV、​2P0R

識別號
别名CAPN9;, GC36, nCL-4, calpain 9
外部IDOMIM:606401 MGI:1920897 HomoloGene:38208 GeneCards:CAPN9
相關疾病
近視[1]
基因位置(人类
1號染色體
染色体1號染色體[2]
1號染色體
钙蛋白酶9的基因位置
钙蛋白酶9的基因位置
基因座1q42.2起始230,747,384 bp[2]
终止230,802,003 bp[2]
基因位置(小鼠
小鼠8号染色体
染色体小鼠8号染色体[3]
小鼠8号染色体
钙蛋白酶9的基因位置
钙蛋白酶9的基因位置
基因座8|8 E2起始125,302,850 bp[3]
终止125,345,470 bp[3]
RNA表达模式


查阅更多表达数据
基因本體
分子功能 calcium ion binding
肽酶活性
半胱氨酸型肽酶活性
水解酶活性
金屬離子結合
calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
細胞組分 胞內
細胞質
细胞组件
生物學過程 消化作用
蛋白酶解
sarcomere organization
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

10753

73647

Ensembl

ENSG00000135773

ENSMUSG00000031981

UniProt

O14815

Q9D805

mRNA​序列

​NM_006615
​NM_016452
​NM_001319676

NM_023709

蛋白序列

NP_001306605
​NP_006606
​NP_057536

NP_076198

基因位置​(UCSC)Chr 1: 230.75 – 230.8 MbChr 8: 125.3 – 125.35 Mb
PubMed​查找[4][5]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

钙蛋白酶9英语:Calpain-9)是一种在人类中由CAPN9基因编码的蛋白质[6][7][8]

钙蛋白酶是普遍存在的、保守的钙依赖性半胱氨酸蛋白酶家族。钙蛋白酶是由不变的小亚基和可变的大亚基组成的异二聚体。大亚基具有半胱氨酸蛋白酶结构域,而两个亚基都具有钙结合结构域。钙蛋白酶与神经退行性过程有关,因为它们的激活可以由钙流入和氧化应激触发。由该基因编码的蛋白质主要在小肠中表达,并可能在消化道中具有特殊功能。该基因被认为与胃癌有关。该基因可编码不同亚型的多个可变剪接转录物变体。[8]

参考资料

  1. ^ 與钙蛋白酶9相關的疾病;在維基數據上查看/編輯參考. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135773 - Ensembl, May 2017
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031981 - Ensembl, May 2017
  4. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  6. ^ Lee HJ, Sorimachi H, Jeong SY, Ishiura S, Suzuki K. Molecular cloning and characterization of a novel tissue-specific calpain predominantly expressed in the digestive tract. Biol Chem. May 1998, 379 (2): 175–184. PMID 9524069. S2CID 37483841. doi:10.1515/bchm.1998.379.2.175. 
  7. ^ Yoshikawa Y, Mukai H, Hino F, Asada K, Kato I. Isolation of two novel genes, down-regulated in gastric cancer. Jpn J Cancer Res. Jul 2000, 91 (5): 459–63. PMC 5926377可免费查阅. PMID 10835488. doi:10.1111/j.1349-7006.2000.tb00967.x. 
  8. ^ 8.0 8.1 Entrez Gene: CAPN9 calpain 9. [2023-01-28]. (原始内容存档于2010-12-05). 

延伸阅读

  • Huang Y, Wang KK. The calpain family and human disease. Trends in Molecular Medicine. 2001, 7 (8): 355–362. PMID 11516996. doi:10.1016/S1471-4914(01)02049-4. 
  • Suzuki K, Sorimachi H, Yoshizawa T, et al. Calpain: novel family members, activation, and physiologic function. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 1996, 376 (9): 523–9. PMID 8561910. doi:10.1515/bchm3.1995.376.9.523. 
  • Davis TL, Walker JR, Finerty PJ, et al. The crystal structures of human calpains 1 and 9 imply diverse mechanisms of action and auto-inhibition. J. Mol. Biol. 2007, 366 (1): 216–229. PMID 17157313. doi:10.1016/j.jmb.2006.11.037. 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. PMC 139241可免费查阅. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899可免费查阅. 
  • Lee HJ, Tomioka S, Kinbara K, et al. Characterization of a human digestive tract-specific calpain, nCL-4, expressed in the baculovirus system. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 362 (1): 22–31. PMID 9917325. doi:10.1006/abbi.1998.1021. 

外部链接

  • Human CAPN9 genome location and CAPN9 gene details page in the UCSC Genome Browser英语UCSC Genome Browser.
  • The MEROPS online database for peptidases and their inhibitors: C02.006
  • PDBUniProt可用的所有結構信息之概述:O14815 (Human Calpain-9 (CAPN9)) 在PDBe-KB英语PDBe-KB
胱天蛋白酶
来自果实
钙蛋白酶
  • CAPN1
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPNS1
  • CAPNS2
组织蛋白酶
其它
EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22 · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9 · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13 · 4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5/99 · 6.1-3英语Template:Ligases CO CS and CN/4/5-6