Egzonukleaza

Egzonukleaza je enzim koji pripada nukleazama, enzimima koji raskidaju fosfodiestareske veze u molekulima nukleinskih kiselina. Egzonukleaze deluju na krajevima nukleinskih lanca, odnosno odvajaju krajnje nukleotide. Reakcija hidrolize kojom se raskidaju fosfodiesterske veze se odvijaja na bilo 3’ ili 5’ kraju. Egzonukleaze su bliko srodne sa endonukleazama, koje razlažu fosfodiestarske veze u sredini polinukleotidnog lanca. Eukariote i prokariote imaju tri tipa egzonukleasa koje učestvuju u normalno manipulaciji iRNK: 5’ do 3’ eksonukleaza, koja je zavisna od dekapirajućeg proteina, 3’ do 5’ egzonukleaza, nezavisni protein, i poli(A)-specifična 3’ do 5’ egzonukleaza.^[1]^[2]

Reference

↑ Mukherjee D, et al. (2004). „Analysis of RNA Exonucleolytic Activities in Cellular Extracts”. Springer protocols 257: 193–211. DOI:10.1385/1-59259-750-5:193. ISBN 1-59259-750-5. PMID 14770007.
↑ Pamela A. Frischmeyer, et al. (2002). „An mRNA Surveillance Mechanism That Eliminates Transcripts Lacking Termination Codons”. Science 295 (5563): 2258–61. DOI:10.1126/science.1067338. PMID 11910109.

Hidrolaze: esteraze (EC 3.1)

3.1.1: Hidrolaze karboksilnih estara

Holinesteraza (Acetilholinesteraza, Butirilholinesteraza) • Pektinesteraza • 6-fosfoglukonolaktonaza • PAF acetilhidrolaza

Lipaza (Zavisna od žučnih soli, Gastrična/Lingvalna, Pankreasna, Lizozomalna, Hormon-sensitivna, Endotelna, Hepatička, Lipoproteinska, Monoacilglicerolna, Diacilglicerolna)

Fosfolipaza (A1, A2, B)

3.1.2: Tioesteraza

Tioesteraza palmitoil proteina • Ubikvitin karboksilni-terminal hidrolaza L1

3.1.3: Fosfataza

Alkalna fosfataza (ALPI, ALPL, ALPP) • Kiselinska fosfataza (Prostatična)/Tartrat-otporna kiselinska fosfataza/Fosfataze purpurne kiseline • Nukleotidaza • Glukoza 6-fosfataza • Fruktoza 1,6-bisfosfataza •

Kalcineurin • Fosfoproteinska fosfataza (PP2A) • OCRL • Piruvat dehidrogenazna fosfataza • Fruktoza 6-P,2-kinaza:fruktoza 2,6-bisfosfataza •PTEN • Fitaza • Inozitol-fosfat fosfataza (IMPA1)

Fosfoproteinska fosfataza: Proteinska tirozinska fosfataza • Proteinska serin/treoninska fosfataza • Fosfataza dualne-specifičnosti

3.1.4: Fosfodiesteraza

Autotaksin • Fosfolipaza (C, D) • Sfingomijelin fosfodiesteraza (1) • PDE1 • PDE2 • PDE3 • PDE4A/PDE4B • PDE5 • Lecitinaza (Clostridium perfringens alfa toksin) • Fosfodiesteraza cikličnih nukleotida

3.1.6: Sulfataza

arilsulfataza (Arilsulfataza A, Arilsulfataza B, Arilsulfataza E, Steroidna sulfataza) • Galaktozamine-6 sulfataza • Iduronat-2-sulfataza • N-acetilglukosamin-6-sulfataza

Nukleaza (obuhvata
deoksiribonukleazu i
ribonukleazu)

3.1.11-16: Eksonukleaza

Eksodeoksiribonukleaza	RecBCD
Eksoribonukleaza	Oligonukleotidaza

3.1.21-31: Endonukleaza

Endodeoksiribonukleaza	Deoksiribonukleaza I • Deoksiribonukleaza II • Deoksiribonukleaza IV • Restrikcioni enzim • UvrABC endonukleaza
Endoribonukleaza	RNaza III • RNaza H (1, 2A, 2B, 2C) • RNaza P • RNaza A (1, 2, 3, 4/5) • RNaza T1 • RNK-indukovani utišavajući kompleks
bilo dezoksi- ili ribo-	Aspergillus nukleaza S1 • Nukleaza mikrokoka

B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6