TFAP2B

TFAP2B
Ідентифікатори
Символи TFAP2B, AP-2B, AP2-B, transcription factor AP-2 beta, PDA2, AP-2beta
Зовнішні ІД OMIM: 601601 MGI: 104672 HomoloGene: 20688 GeneCards: TFAP2B
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, метаболічні захворювання, Char syndrome, patent ductus arteriosus 2[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
sequence-specific DNA binding
GO:0001106 transcription corepressor activity
protein dimerization activity
protein homodimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
protein heterodimerization activity
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма

Біологічний процес

GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
forelimb morphogenesis
collecting duct development
cellular urea homeostasis
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
sympathetic nervous system development
retina layer formation
positive regulation of urine volume
glucose homeostasis
calcium ion homeostasis
distal tubule development
розвиток нирки
regulation of insulin secretion
phosphate ion homeostasis
cellular creatinine homeostasis
negative regulation of apoptotic process
transcription by RNA polymerase II
metanephric nephron development
aorta morphogenesis
magnesium ion homeostasis
hindlimb morphogenesis
transcription, DNA-templated
response to lithium ion
regulation of BMP signaling pathway
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of neuron apoptotic process
cellular ammonium homeostasis
potassium ion homeostasis
positive regulation of cell population proliferation
renal water homeostasis
glucose metabolic process
sensory organ development
регуляція диференціювання клітин
sodium ion homeostasis
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
fat cell differentiation
ductus arteriosus closure
negative regulation of cell population proliferation
skin development
GO:0097285 апоптоз
negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7021
21419
Ensembl
ENSG00000008196
ENSMUSG00000025927
UniProt
Q92481
Q61313
RefSeq (мРНК)
NM_003221
NM_001025305
NM_001286340
NM_009334
RefSeq (білок)
NP_003212
NP_001020476
NP_001273269
NP_033360
Локус (UCSC) Хр. 6: 50.82 – 50.85 Mb Хр. 1: 19.28 – 19.31 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TFAP2B (англ. Transcription factor AP-2 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 460 амінокислот, а молекулярна маса — 50 474[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHSPPRDQAAIMLWKLVENVKYEDIYEDRHDGVPSHSSRLSQLGSVSQGP
YSSAPPLSHTPSSDFQPPYFPPPYQPLPYHQSQDPYSHVNDPYSLNPLHQ
PQQHPWGQRQRQEVGSEAGSLLPQPRAALPQLSGLDPRRDYHSVRRPDVL
LHSAHHGLDAGMGDSLSLHGLGHPGMEDVQSVEDANNSGMNLLDQSVIKK
VPVPPKSVTSLMMNKDGFLGGMSVNTGEVFCSVPGRLSLLSSTSKYKVTV
GEVQRRLSPPECLNASLLGGVLRRAKSKNGGRSLRERLEKIGLNLPAGRR
KAANVTLLTSLVEGEAVHLARDFGYICETEFPAKAVSEYLNRQHTDPSDL
HSRKNMLLATKQLCKEFTDLLAQDRTPIGNSRPSPILEPGIQSCLTHFSL
ITHGFGAPAICAALTALQNYLTEALKGMDKMFLNNTTTNRHTSGEGPGSK
TGDKEEKHRK

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Moser M., Buettner R. (1997). Enhanced apoptotic cell death of renal epithelial cells in mice lacking transcription factor AP-2beta. Genes Dev. 11: 1938—1948. PMID 9271117 DOI:10.1101/gad.11.15.1938
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Eloranta J.J., Hurst H.C. (2002). Transcription factor AP-2 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is sumolated in vivo. J. Biol. Chem. 277: 30798—30804. PMID 12072434 DOI:10.1074/jbc.M202780200
  • Khetyar M., Syrris P., Tinworth L., Abushaban L., Carter N. (2008). Novel TFAP2B mutation in nonsyndromic patent ductus arteriosus. Genet. Test. 12: 457—459. PMID 18752453 DOI:10.1089/gte.2008.0015

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TFAP2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11743 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
  5. UniProt, Q92481 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші