Fosfoglicerat kinaza

Fosfoglicerat kinaza
Identifikatori
EC broj2.7.2.3
CAS broj9001-83-6
Baze podataka
IntEnzIntEnz pregled
BRENDABRENDA pristup
ExPASyNiceZyme pregled
KEGGKEGG pristup
MetaCycmetabolički put
PRIAMprofil
Strukture PBPRCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Ontologija genaAmiGO / EGO
Pretraga
PMCčlanci
PubMedčlanci
NCBIproteini
Fosfoglicerat kinaza
Struktura kvašćane fosfoglicerat kinaze.[1]
Identifikatori
SimbolPGK
PfamPF00162
InterProIPR001576
PROSITEPDOC00102
SCOP3pgk
SUPERFAMILY3pgk
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Fosfoglicerat kinaza (EC 2.7.2.3) (PGK) je enzim koji katalizuje reverzibilni transfer fosfatne grupe sa ATP-a na 3-fosfoglicerat proizvodeći ADP i 1,3-bisfosfoglicerat. Popout svih kinaza PGK je transferaza. Glukoneogeneza i Kalvinov ciklus, koji su anabolički putevi, koriste ATP i vrše reakciju u suprotnom smeru. Glikoliza, katabolički put, koristi reverznu reakciju da proizvede ATP. Postoje varijante glikolize koje ne koriste PGK.

Mehanizam i struktura

Fosfoglicerat kinaza je prisutna u svim živim organizmima i njena sekvenca je visoko konzervirana tokom evolucije. Ovaj enzim je monomer koji sadrži dva domena približno jednake veličine koji odgovaraju N- i C-kraju proteina. 3-fosfoglicerat (3-PG) se vezuje za N-terminal, dok se nukleotidni supstrati, MgATP ili MgADP, vezuju za C-terminalni domen enzima.[2] U osnovi svakog domena je šestolančana paralelna beta ravan okružena alfa heliksima. Domeni imaju sposobnost nezavisnog savijanja.[3][4]

Ljudski izozimi

Fosfoglocerat kinaza 1
Identifikatori
SimbolPGK1
Entrez5230
HUGO8896
OMIM311800
RefSeqNM_000291
UniProtP00558
Ostali podaci
EC broj2.7.2.3
LokusHromozom X q13.3
Fosfoglocerat kinaza 2
Identifikatori
SimbolPGK2
Entrez5232
HUGO8898
OMIM172270
RefSeqNM_138733
UniProtP07205
Ostali podaci
EC broj2.7.2.3
LokusHromozom 6 p21-q12

Deficijencija fosfoglicerat kinaze (PGK) je vezana za hemolitičku anemiju i mentalne poremećaje kod ljudi.[5]

Reference

  1. ^ Watson HC; Walker NP; Shaw PJ; et al. (1982). „Sequence and structure of yeast phosphoglycerate kinase”. EMBO J. 1 (12): 1635—40. PMC 553262 Слободан приступ. PMID 6765200. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  2. ^ Kumar S, Ma B, Tsai CJ, Wolfson H, Nussinov R (1999). „Folding funnels and conformational transitions via hinge-bending motions”. Cell Biochem. Biophys. 31 (2): 141—164. PMID 10593256. 
  3. ^ Yon JM, Desmadril M, Betton JM, Minard P, Ballery N, Missiakas D, Gaillard-Miran S, Perahia D, Mouawad L (1990). „Flexibility and folding of phosphoglycerate kinase”. Biochimie. 72 (6-7): 417—429. PMID 2124145. 
  4. ^ Zerrad L, Merli A, Schröder GF, Varga A, Gráczer É, Pernot P, Round A, Vas M, Bowler MW (2011). „A spring-loaded release mechanism regulates domain movement and catalysis in phosphoglycerate kinase”. J. Biol. Chem. 286 (16): 14040—8. PMC 3077604 Слободан приступ. PMID 21349853. doi:10.1074/jbc.M110.206813. 
  5. ^ Yoshida A, Tani K (1983). „Phosphoglycerate kinase abnormalities: functional, structural and genomic aspects”. Biomed. Biochim. Acta. 42 (11-12): —. PMID 6689547. 

Literatura

  • Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 

Spoljašnje veze

  • Phosphoglycerate+kinase на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
  • Illustration at arizona.edu
  • п
  • р
  • у
Glikoliza
Glukoneogeneza
to oksaloacetat:
iz laktata (Korijev ciklus):
iz alanina (Alaninski ciklus):
iz glicerola:
Regulatorni
  • п
  • р
  • у
Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)
2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH akceptor
2.7.2: COOH akceptor
2.7.3: N akceptor
2.7.4: PO4 akceptor
2.7.6: difosfotransferaze
(P2O7)
2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO4-nukleozid)
Polimeraza
DNK polimeraza
  • DNK-usmerena DNK polimeraza: DNK polimeraza I
  • DNA polimeraza II
  • DNA polimeraza III holoenzim

RNK-usmerena DNA polimeraza: Reverzna transkriptaza (Telomeraza)

DNK nukleotidileksotransferaza/Terminalna deoksinukleotidil transferaza

RNK nukleotidiltransferaza
Fosforolitička
3' do 5' eksoribonukleaza
Uridililtransferaza
Guanililtransferaza
Druge
2.7.8: razno
Fosfatidiltransferaze
Glikozil-1-fosfotransferaza
  • N-acetilglukozamin-1-fosfat transferaza
2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO4; proteinski akceptor)
2.7.10: proteinske-tirozinske
  • vidi tirozinske kinaze
2.7.11: proteinske-serin/treonin
  • vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost
  • vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske
  • Protein-histidinske pros-kinaze
  • Proteinske-histidinske tele-kinaze
  • Histidinske kinaze
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • п
  • р
  • у
Teme
Tipovi
  • B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
Portali:
  •  Molekularna i ćelijska biologija
  •  Hemija
Нормативна контрола Уреди на Википодацима
  • Енциклопедија Британика